從組織架構上，北草中藥健康產業園主要分為三大版塊：

第一版塊：商業運營版塊——傳播中醫藥文化的中藥材產業鏈黑龍江北草堂中藥材有限責任公司、百年世一、哈爾濱北寶醫藥有限公司、黑龍江品諾質量管控有限公司、黑龍江北草種植示范基地有限公司、黑龍江北草堂中醫藥研究院、哈爾濱市綠色中醫中藥研究院、黑龍江正韜智能科技有限責任公司。

第二版塊：公益版塊——推動公益事業發展、實現社會價值黑龍江省陽光健康公益基金會、黑龍江省益道文化創意有限公司、黑龍江省攜鄰超市有限公司、哈爾濱鐳射科技有限公司、哈爾濱云禾膜結構有限公司。

第三版塊：服務運營版塊——面向產業園商業、公益版塊及外部企業提供專業支持性服務黑龍江省益創文化傳媒有限公司、黑龍江惠善信息咨詢服務有限責任公司、黑龍江益信財務管理有限公司、黑龍江省思治人力資源服務有限公司。

目前，北草中藥健康產業園已入駐和即將入駐企業27家，公益基金會1家，經營范圍涵蓋中醫藥技術研發、市場拓展、醫藥銷售、公益服務、互聯網、智能制造等領域，形成了一個包涵生產鏈、技術鏈、企業鏈、供需鏈、價值鏈在內的全產業鏈的服務體系。