崗位職責 一、單細胞測序數據分析 1、負責單細胞轉錄組（scRNA-seq）、空間轉錄組（spatial transcriptomics）、多組學整合數據的處理與分析，包括數據質控（QC）、序列比對、基因表達定量、細胞聚類、差異表達分析及功能注釋。 2、構建細胞類型注釋流程（如使用SingleR、CellID等工具），完成細胞亞群鑒定及細胞發育軌跡推斷（擬時序分析）。 3、開發定制化分析腳本（Python/R），支持個性化研究需求（如細胞互作網絡、細胞狀態轉換模型）。 4、 熟悉單細胞ATAC和免疫組庫（TCR/BCR）分析流程。 二、分析流程開發與優化 1、搭建和維護單細胞測序分析標準化流程，整合開源工具。 2、 優化算法參數，提升數據處理效率（如并行計算、云計算資源調度）。 三、生物信息學工具開發 1、開發自動化報告生成工具，實現分析結果可視化（R Shiny、Plotly、Dash）。 2、 構建內部數據庫，管理單細胞公共數據集（如HCA、Tabula Sapiens）及公司內部實驗數據。 四、跨團隊協作 1、與實驗團隊合作設計測序方案，驗證生物信息學預測結果（如差異基因的qPCR驗證）。 2、為臨床或藥研團隊提供數據解讀支持，輸出可落地的生物學洞見。 任職要求 教育背景 生物信息學、計算生物學、統計學、計算機科學或相關領域本科及以上學歷（碩士優先）。 技術能力 編程與工具： 精通Python和R語言，熟悉Linux環境及Shell腳本編程。 熟練使用單細胞分析工具（Seurat、Scanpy、Cell Ranger、STAR、Salmon）。 熟悉生物信息學數據庫（NCBI、ENA、Single Cell Portal）及常用算法（UMAP、t-SNE、WGCNA）。 數據分析經驗： 至少2年以上單細胞測序數據分析經驗，完整參與過至少1個單細胞項目（從原始數據到生物學結論）。 熟悉單細胞數據降噪、批次校正（Harmony、BBKNN）及細胞通訊分析（CellPhoneDB、CellChat）。 加分項： 有多組學（scRNA+ATAC/CITE-seq）整合分析經驗。 熟悉云計算平臺（AWS、阿里云）及容器化技術（Docker/Singularity）。 有算法開發經驗（如自定義聚類算法或軌跡推斷模型）。 其他要求 具備快速學習能力，能獨立跟蹤領域前沿技術（如空間多組學、機器學習驅動的細胞注釋）。 良好的跨學科溝通能力，能將復雜分析結果轉化為可理解的生物學結論。 英語熟練，能高效閱讀文獻及技術文檔。 優先考慮條件 1、在國際期刊發表過單細胞相關論文。 2、有藥物研發背景（如腫瘤微環境解析、免疫細胞圖譜構建）。 3、熟悉FDA/EMA的生物信息學數據提交規范（如FAIR原則）。